栖灵塔共九层，始建于隋仁寿元年(601)，唐代诗人李白、高适、刘长卿、蒋涣、陈润、刘禹锡、白居易均曾登临，并留下千古绝唱，反映了被誉为“中国之尤峻特者”的栖灵塔气势磅礴、高耸云天的雄伟气概。

    栖灵塔自唐会昌三年(843)毁灭，大明寺只剩“栖灵遗址”，而无栖灵宝塔，香客和游人深深引为憾事。到了宋真宗景德元年（1004），僧人可政募集资金建造了一座七级多宝塔。这座宝塔又于南宋时毁圮，自此，大明寺再也没有重建栖灵塔之举。

    时值1980年，鉴真大师像从日本回扬州“探亲”，各界人士倡议重建栖灵塔，励图宏业。大明寺僧众在有关部门的支持下，多方筹集资金，准备兴建。1988年，大明寺主持僧瑞祥法师在该寺东园择址奠基，仪式隆重，并立石为记。瑞祥法师圆寂后，能修法师赓续其志，募化资金，虔心操作，企求早日建成栖灵塔。

    根据扬州市计委“扬计（93）字第313号”《关于扬州大明寺重建栖灵塔项目计划》的批复，大明寺将设计要求委托于扬州市建筑设计院。首先为栖灵塔定点及方案设计，市领导及有关单位非常重视，从1993年3月23日至7月29日，魏芝田副市长及朱加强副秘书长和市建委、规划局、文管会、园林局、宗教局、建筑设计院、大明寺等单位，在先后召开的八次会议上共商大计。其中有两次还特邀东南大学潘谷西教授、同济大学路秉杰教授论证。栖灵塔的定点及方案最终在7月29日确定。扬州建筑设计院聘请潘德华带领工程技术人员，根据有关栖灵塔的点滴文献记载，复经实地调研、考察国内现存唐塔，结合自己的工作经验，设计了这座仿唐宝塔。新建塔为仿木构楼阁式。原设计欲制成木塔，可惜优质大直径的杉木在国内很难筹集，于是更改方案，采用钢筋混凝土结构与木构结合。平座、剪力墙为混凝土，铺作做三层钢筋混凝土、二层木构。剪力墙上贴斗拱、木枋等，建成仿木构楼阁式。塔为方形，九层；各层东西南北每四柱三间，一门两窗，平座，腰檐，平座与屋檐由斗拱支撑，出檐大而平，柱以腰鼓形，窗形直棂，凸现唐代建筑风格。

    建筑用料，精心检选，木石两大类，尤加重视。所有木制构件材类，一律用自然生长杉木，并认真阴干，严格杜绝掺用、误用速生杉木和松木。石材则预先详细了解材质的抗压强度与理论重量及色彩，经选定后方进料使用。

    栖灵塔塔身方形，底层平面为22米×22米，面积484平方米。九级佛塔置于2.50米高的承台之上，塔下设地宫，深4米。建筑总面积1865平方米。塔高各层不一，第一层8.10米、第二层7.15米、第三层6.55米、第四层6.45米、第五层6.35米、第六层6.25米、第七层6.15米、第八层6.05米、第九层7.40米，塔尖8.55米，包括地宫在内总高度73米。

    在政府的大力支持下，加上海内外缁素大众、护法檀越广种福田，共襄盛举，集得重建栖灵塔资金，终于在1993年8月27日破土动工，开机钻探，12月7日打入桩基，工程桩柱36根，另有锚固桩9根，每根桩径为0.9米，桩深25米。经过两年多的紧张施工，于1995年岁末落成。

    栖灵塔的底层台基、踏道的基面皆为花岗岩麻石。台基的压栏石、衬土石、角石、角柱、隔身板柱等石构件，皆安装严密，处置妥贴，尺寸标准，衔接得天衣无缝。踏道的阶石、副子石、衬土石、象眼石等构置精良、美观大方，与台基交圈，榫接得珠连璧合。

    一至九层地面、楼面、平座面皆为清水磨砖架空层。方砖厚60毫米，龙墙宽240毫米，上座1∶1黄粘土，石灰膏，加百分之五水泥，掼浓铺设，软下方砖，复用油灰腻平砖缝。

    外墙、内墙，所有现浇、预制的裸露的混凝土浇制的柱、墙、梁、枋、斗拱等构件，一律为清水模板，不加粉刷，表面显得平整、光洁。

    屋面，铺设银灰色琉璃筒瓦，“五样”。瓦铺盖时，严格按“压六露四”搭接瓦面。檐口瓦当每隔一块，中部预留直径40毫米的孔，供避雷系统用。铺设时用1∶1煤碴屑、纸筋石灰，另加百分之三的水泥苫背。屋面由于出檐较大，超过了斗拱出跳尺寸，故在圈梁上预留椽窝，以加强椽尾压槽。

    栖灵塔“铺作”，参照佛光寺大殿与南禅寺大殿的斗拱作法，但昂头未采用国内的“批竹昂”，而取日本唐招提寺金堂“方斗昂”，以其不失古风。“补间铺作”，依旧参照山西佛光寺大殿的做法，即“出跳下减斗和一华拱”。

    栖灵塔楼梯，依唐人刘长卿《登栖灵寺塔诗》“盘梯接云气，半壁栖夜魄”诗意，作“壁内析上式”梯形。另据佛教教义，和尚上殿念经，是由门的左边进殿，念完经靠右出殿，作顺时针行走，故塔中楼梯也依顺时针盘旋而上。楼梯栏杆用卧棂做法。

    塔内外，上下天光，皆用油漆细加髹刷。拱眼壁、栏额与腰串之间，柱与柱之间，腰串与地袱之间，心柱与柱之间油漆成白色；门窗、天花、梁枋、斗拱、椽等油漆成紫檀木色。两种色彩分明，相映成趣，十分悦目。
栖灵塔的一些建筑设置、配件、装饰，设计时也颇具匠心，构思巧妙，内涵丰富，主要体现在三方面：一是采用内外槽做法，内槽内供七世佛：释迦牟尼佛、毗婆尸佛、尸弃佛、毗舍婆佛、拘楼孙佛、拘那含佛、迦叶佛。每层四面同四尊。外槽内供游客回拜，即千佛绕毗卢之意。二是一至九层须弥座，施1150只莲花瓣，寓塔毁至重建时隔1150年。三是塔设金铎，分置在仔角梁、塔刹、华盖，四道铜索各36只，合计108只。依《三藏法数》闻钟声，除众生108种烦恼。

    新建成的栖灵塔气势雄伟，在绿杨城郭的许多地方远远地就能目睹这九级浮屠的风姿。游览大明寺，在大雄宝殿廊檐左序东折处就发现有一通道，入通道即可抵达栖灵塔前。塔尖刺入云端，塔的第三层四面各自悬挂一块长方形的“栖灵塔”蓝底金字匾。宝塔每层四角的飞檐下，皆垂有风铃，清风吹来，叮当作响，与塔内传出的梵音浑为一体。